Вторая теория предполагала, что причиной развития эпидемий является распространение живого болезнетворного агента среди людей. Этой точки зрения придерживался древнегреческий философ Аристотель (384-322 до н.э.). Постоянная дискуссия между сторонниками двух теорий послужила основой для дальнейшего развития эпидемиологии.
Развитие микроскопических исследований начиная с А.Левенгука привело к великим микробиологическим открытиям. Исследования Л.Пастера, Р.Коха и их учеников во второй половине XIX века привели к разработке множества практических мер в борьбе с заразными заболеваниями: современная диагностика, использование дезинфекции, разработка и введение в широкую практику специфических мер профилактики с помощью вакцин и сывороток и т.д.
Развитие эпидемиологии делится на следующие периоды:
Для изучения закономерностей распространения инфекционных болезней используют совокупность нескольких исследовательских методических приемов или комплексный эпидемиологический метод.