Прежде всего Бакинский совет постарался разоружить все силы, способные защитить тюрко-мусульманское население, являвшееся подлинными хозяевами города. 27 марта были разоружены азербайджанские военные на пароходе «Эвелина», готовившемся отплыть в Лянкяран.
30 марта 1918 года большевистско-дашнакские вооруженные силы под руководством Бакинского Совета начали осуществление геноцида тюрко-мусульманского населения города Баку. В результате длившегося трое суток погрома было убито самым жестоким образом около 12 тысяч человек мирного населения города. Враг не щадил ни женщин, ни стариков, ни детей. Были сожжены жемчужина бакинской архитектуры здание «Исмаилийя», театр Тагиева, редакции газет «Ачыг сёз» и «Каспий», разрушена мечеть Тезепир. Основной организатор мартовского геноцида С.Шаумян в своем официальном отчете В.И.Ленину о погромах в Баку писал: «Мы шли сознательно на это. Результаты боев блестящие для нас. Разгром противника был полнейший. ...У «Дашнакцутюн» имелось также около 3-4 тысяч национальных частей, которые были в нашем распоряжении. Если б в Баку взяли верх мусульманские контрреволюционеры, город был бы объявлен столицей Азербайджана. Их победа в Баку привела бы к потере Закавказья (Южного Кавказа - ред.) для России». Говоря о «мусульманских контрреволюционных элементах», Шаумян имел в виду убитых мирных жителей Баку.
Большевистско-дашнакские вооруженные силы в начале апреля 1918 года начали расширять масштабы национального погрома. Этими силами были уничтожены 110 сел в Шамахинском уезде. Было убито более 20 тысяч тюрко-мусульманского населения. Подавляющее большинство жертв этого армянского зверства составляли женщины, дети и старики. По приказу помощника Шаумяна С.Лалаяна в Ша- махе были сожжены мечети, в которых укрылись от погрома старики, женщины и дети. Вооруженный отряд другого представителя Шаумяна - Амазаспа - сжёг или уничтожил 167 сел Губинского уезда и город Губу.