Позже Гаджи Челеби, видя как народ изнывает от произвола Мелик Наджафа, поднял восстание и наказал его. Услышав об этом, Надир шах предпринял поход на Шеки. Его войско осадило город. Шекинцы, возглавляемые Гаджи Челеби, скрылись в знаменитой крепости «Гялясян-гёрасан» («Придёшь-увидишь»). После трёхлетней борьбы Надир шах вынужден был прийти к согласию и заключить мир с Гаджи Челеби. На самом деле, это означало образование независимого Шекинского ханства. Шекинское ханство, образованное в результате бунта против Надир шаха, было первым независимым азербайджанским ханством.
Спустя некоторое время Надир шах Афшар был убит в результате покушения. Государство, созданное им, распалось. Азербайджанские земли были поделены на мелкие государства - ханства. Это, в свою очередь, стало причиной нападений на наши земли соседних государств. Для предотвращения вражеских нападений Гаджи Челеби хан проводил политику объединения азербайджанских земель.